Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SSBP4Q9BWG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms