Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC94Q9BW85 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms