Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf16Q9BUW7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf16Q9BUW7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms