Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBB6Q9BUF5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBB6Q9BUF5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms