Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRACR2AQ9BSW2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms