Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
LPIN3Q9BQK8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LPIN3Q9BQK8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms