Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RETNLBQ9BQ08 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms