Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN18Q99952 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN18Q99952 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms