Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RBBP8Q99708 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RBBP8Q99708 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms