Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MYCBPQ99417 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MYCBPQ99417 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms