Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSRNP1Q96S65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSRNP1Q96S65 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms