Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PRAM1Q96QH2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAM1Q96QH2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms