Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SORCS2Q96PQ0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SORCS2Q96PQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms