Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NEUROD6Q96NK8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEUROD6Q96NK8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms