Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JSRP1Q96MG2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JSRP1Q96MG2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms