Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PKNOX2Q96KN3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PKNOX2Q96KN3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms