Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK5RAP3Q96JB5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms