Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZBED3Q96IU2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZBED3Q96IU2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
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