Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms