Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM4SF18Q96CE8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM4SF18Q96CE8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms