Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUNDC1Q96C34 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms