Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM43Q96BQ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM43Q96BQ3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms