Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFRSF25Q93038 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFRSF25Q93038 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms