Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CELF1Q92879 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CELF1Q92879 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms