Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSC1Q92574 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSC1Q92574 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms