Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSPC1Q8WXF1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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