Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRSF12Q8WXF0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms