Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCAF4Q8WV16 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms