Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GIPC3Q8TF64 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GIPC3Q8TF64 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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