Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZNF397Q8NF99 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms