Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHLHE23Q8NDY6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms