Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDCL2Q8N4E4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms