Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CMTR1Q8N1G2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMTR1Q8N1G2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms