Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUG1

KRTAP1-3, Keratin-associated protein 1-3, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-3Q8IUG1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KRTAP1-3Q8IUG1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KRTAP1-3Q8IUG1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms