Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPFIBP1Q86W92 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPFIBP1Q86W92 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms