Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UBE2Q1Q7Z7E8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBE2Q1Q7Z7E8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms