Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KRT25Q7Z3Z0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms