Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT28Q7Z3Y7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT28Q7Z3Y7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms