Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYFIP1Q7L576 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms