Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
HECW1Q76N89 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
HECW1Q76N89 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms