Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
BBS12Q6ZW61 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms