Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBR3Q6ZT12 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBR3Q6ZT12 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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