Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC36A4Q6YBV0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC36A4Q6YBV0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms