Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX04

CWC27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC27Q6UX04 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC27Q6UX04 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC27Q6UX04 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms