Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DUX4L9Q6RFH8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms