Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KCNIP4Q6PIL6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms