Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDC4Q6P2E9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
EDC4Q6P2E9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms