Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
APOBEC3HQ6NTF7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
APOBEC3HQ6NTF7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms