Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC70Q6NSX1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC70Q6NSX1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms