Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms